1994年に設立されたウズベキスタンと日本とウズベキスタンの経済協力委員会は、貿易と経済関係の発展に重要な役割を果たしています。これらの委員会の第15回合同会議は2019年7月に東京で開催されました。
2008年8月に、政府間協定「自由化、相互保護、投資の奨励について」が署名され、2009年9月24日に施行されました。22の合弁事業 (その内の8つは100%日本の資本金による) がウズベキスタンで設定されました。日本企業の代表15名がウズベキスタンで認定されています。
2019年の二国間貿易は4億1360万ドルでした。
日本のウズベキスタンに対する財政的および技術的支援の総額は、41億ドルを超えました。日本からのウズベキスタンへの財政的および技術的支援により、健康、教育、エネルギー、輸送、電気通信などの分野で多くの社会的に重要なインフラプロジェクトが実施されました。
1999年以来、国際協力機構(JICA)と日本貿易振興機構(JETRO)の地域事務所、およびウズベキスタン日本センターがウズベキスタンで活動しています。